AlphaGenome是谷歌DeepMind推出的全新AI模型,能更深入地理解基因组。模型能接收长达100万个碱基对的DNA序列输入,预测数千种表征其调控活性的分子特性,评估基因变异的影响。模型基于卷积层、Transformer架构,训练数据来自大型公共数据库。模型具有长序列上下文与高分辨率、全面多模态预测、高效变异评分和新颖剪接点建模等优势,在多项基准测试中表现顶尖,基于API向非商业研究领域开放,有望推动疾病研究、基因治疗和基础生命科学的发展。
AlphaGenome的主要功能
- 预测基因调控特性:预测基因的起始和终止位置、RNA剪接、生成数量,及DNA碱基的可及性等。
- 评估基因变异影响:对比突变前后序列的预测结果,高效评估基因变异的影响。
- 助力疾病研究:帮助精确定位疾病潜在原因,发现新的治疗靶点。
- 指导合成生物学设计:设计具有特定调控功能的合成DNA。
- 加速基础研究:协助绘制基因组功能元件图谱,加深对基因组的理解。
AlphaGenome的项目地址
- 项目官网:https://deepmind.google/discover/blog/alphagenome-ai-for-better-understanding-the-genome/
- 技术论文:https://storage.googleapis.com/deepmind-media/papers/alphagenome.pdf