Chai-2,这是分子设计领域的一项重大突破。Chai-2 在设计完全从头抗体时实现了前所未有的两位数成功率,与以往方法相比,命中率提高了几个数量级。只需测试 20 个设计,该模型就能在各种靶点中轻松找到可行的匹配方案。该模型的高成功率和广泛的泛化能力为快速精准的原子级分子工程新时代铺平了道路。
我们挑战 Chai-2 设计多达 20 种抗体或纳米抗体,以针对 52 个不同的蛋白靶点,所有这些靶点 在SAbDab(RCSB 蛋白质数据库的一个子集)中均缺乏现有的抗体结合物。值得注意的是,在单轮实验中,我们实现了 16% 的结合率,并发现了至少一种针对 50% 靶点的成功结合物。除了抗体之外,Chai-2 在微型蛋白结合物设计中还展现出 68% 的湿实验室命中率,通常能够达到皮摩尔级的亲和力。
Chai-2 卓越的成功率标志着分子发现方式的范式转变。从随机筛选到有针对性的、可编程的发现的转变表明,曾经因实验挑战而被认为无法成药的抗原,有可能通过计算设计来解决。按需生成表位特异性结合物还可以简化先进治疗形式的开发,例如抗体-药物偶联物、双互补位构建体和其他多功能生物制剂。此外,通过原子层面的推理——包括配体和翻译后修饰——Chai-2 的框架自然而然地超越了传统的生物制剂,扩展到大环化合物、肽、酶和小分子。
Chai Discovery 的使命是将生物学从一门科学转化为工程学。我们相信,Chai-2 的成果标志着这一征程中的一个重要里程碑,标志着从经验性发现向确定性分子工程的转变。总而言之,我们认为我们的成果将计算优先设计确立为现代发现平台不可或缺的组成部分。