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AlphaGenome是谷歌DeepMind推出的全新AI模型,能更深入地理解基因组。模型能接收长达100万个碱基对的DNA序列输入,预测数千种表征其调控活性的分子特性,评估基因变异的影响。模型基于卷积层、Transformer架构,训练数据来自大型公共数据库。模型具有长序列上下文与高分辨率、全面多模态预测、高效变异评分和新颖剪接点建模等优势,在多项基准测试中表现顶尖,基于API向非商业研究领域开
1. VarDrug 引入了一个机器学习框架,用于预测基因变异如何影响药物反应,重点关注精神类药物。它使用来自 PharmGKB 的数据来解决变异体-药物相互作用问题,并比基于规则的方法取得了显著的性能提升。 2. 其核心是一个自监督变异编码器,该编码器基于 100,000 个人类基因组变异体进行训练,并使用 DNABERT2 嵌入对每个变异体的基因组背景进行编码。将此变异编码器添加到标准机器学
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