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Spateo

Spateo（https://github.com/aristoteleo/spateo-release），这是一个3D时空建模框架，并将其应用于E9.5和E11.5的3D小鼠胚胎发生图谱，捕获了800万个细胞。Spateo支持可扩展、部分、非刚性对齐、多层细化和网格校正，以创建整个胚胎的分子全息图。它引入了数字化方法，揭示了从亚细胞到整个器官的多层次生物学，识别了新兴3D结构（例如，中脑-后脑边