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1. PDeepPP 通过将 ESM-2 蛋白质语言模型嵌入与混合 Transformer-CNN 架构融合,引入了统一的肽识别深度学习框架。该设计在各种生物信息学任务中均实现了高精度和可扩展性。 2. PDeepPP 在 33 项基准生物学任务中的表现显著优于先前的方法,包括抗菌、抗癌和糖基化位点识别。在抗菌肽检测中,其准确率达到 97.26%,PR AUC 为 0.9977,在抗疟药检测
MegaFold是一个跨平台系统,用于加速蛋白质结构预测模型(例如 AlphaFold3、AlphaFold2)。 为什么选择 MegaFold? 跨平台支持:通过优化的基于 Triton 的内核,支持在异构设备上执行,包括 NVIDIA GPU 和 AMD GPU。 易于使用:只需更改几行代码即可获得巨大的性能提升 速度提升:每次迭代训练时间加快高达 1.73 倍 减少内存:将
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